水稻基因组中的tRNA和rRNA基因

摘要：

在最近完成测序的水稻籼稻和粳稻两个亚种基因组中,各找到564和519个较为可靠的tRNA基因,进一步证实了于2002年发表的基于基因组序列草图的分析结果.修正的摆动假设,即至少需要46种tRNA基因才能译出61种可能的反密码子,在这两个亚种中均准确成立.在这46种tRNA中,有些在籼稻和粳稻中的序列均全同.有18种水稻tRNA与拟地芥中的相应序列全同.在籼稻基因组序列中还发现了384个5S rRNA基因,一批17S和5.8S rRNA基因以及一个25S rRNA基因.这些rRNA基因的不完备是由于它们通常以串接阵列形式存在于异染色质区域,而后者在全基因组霰弹法测序中不易完整测出.在tRNA和rRNA基因序列这间发现了多处互补片段,这将有助于研究它们的进化和相互作用.

关键词： 水稻基因组 转移核糖核酸(tRNA) 转移核糖核酸基因 籼稻 粳稻

作者: 王希胤 史晓黎 郝柏林

作者单位: 北京大学生物信息中心(北京);中国科学院北京基因组研究所(北京);河北理工大学理学院(唐山) 北京大学生物信息中心(北京);中国科学院北京基因组研究所(北京) 中国科学院北京基因组研究所(北京);复旦大学理论生命科学研究中心(上海);中国科学院理论物理研究所(北京)

会议类型: 国内会议

会议名称: 2004北京植物分子生物学与生物信息学国际研讨会

会议地点: 北京

会议语种:中文

页码: 1-7

在线出版日期: 2004-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）