基于支持向量机方法的同源寡聚蛋白质分类

摘要：

本文用支持向量机方法从蛋白质一级结构出发区分同源二聚体、同源三聚体、同源四聚体和同源六聚体.蛋白质原始序列的子序列分布用作支持向量机的输入向量,从而充分考虑了蛋白质序列的信息.实验表明残基顺序对同源寡聚蛋白质的识别起重要作用,而支持向量机方法是同源寡聚蛋白质分类的有效工具.这也进一步证实了蛋白质一级结构包含着四级结构信息.

关键词： 蛋白质四级结构 同源寡聚体 支持向量机 子序列分布 分类 生物信息学

作者: 宋杰 唐焕文

作者单位: 大连理工大学应用数学系(辽宁大连);韶关学院数学系(广东韶关) 大连理工大学应用数学系(辽宁大连)

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国运筹学会第七届学术交流会

会议地点: 青岛

会议语种:中文

页码: 1288-1295

在线出版日期: 2004-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）