水稻胆色素原脱氨酶基因的生物信息学分析
胆色素原脱氨酶(PBGD)是卟啉合成的第二个限速酶,其突变与一些遗传病相关,高等植物中胆色素原脱氨酶的突变可能导致一些色素代谢突变体.本文通过EST拼接获得了水稻PBGD的cDNA全长,并进一步确定水稻PBGD基因的完整结构.对其叶绿体定向肽切割点,蛋白的空间结构模型,启动子区的转录因子结合点等进行了分析.结果表明水稻PBGD基因由5个外显子和四个内含子组成,该基因编码358个氨基酸残基的蛋白,该蛋白具有34个氨基酸残基的叶绿体定向肽.水稻PBGD启动子区具有GA-MYB、ATHB1、ATHB1、PBF、DOF1、DOF2、DOF3等转录因子结合为点,这暗示水稻PBGD基因的转录并非是组成性的,其表达可能与细胞的分裂和分化有一定关系.
水稻 胆色素原脱氨酶 基因结构启动子 生物信息
范三红 郭蔼光
西北农林科技大学陕西省农业分子生物学重点实验室(陕西杨陵)
国内会议
福州
中文
14-17
2002-09-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)