汉坦病毒西安分离株84FLi的L片段核苷酸序列测定以及分析
采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),分节段扩增汉滩病毒84Fli的L基因片段cDNA,纯化的PCR产物片段直接用于序列测定或克隆入Pmc18-T载体中进行测序.结果表明,84Fli株的L片段cDNA由6533个核苷酸组成,四种核苷酸的比例分别为A33.39﹪,C16.43﹪,G20.74﹪,T29.44﹪.GC含量为37.17﹪,AT含量为62.83﹪.推导出的最大开放读码框为从38到6493,共编码2151个氨在酸.序列同源性分析表明,84Fli株核苷酸与HTN型国际标准毒株76~118的同源性为83.7﹪,差异性为18.8﹪;而与中国株A9的同源性高达97.6﹪,差异性仅为2.4﹪.与SEO型代表株Seou180-39的同源性为75.2﹪,与中国株L99的同源性为75.3﹪.与PUU、SN、AND和TUL等其它型汉坦病毒的同源性为66.1~66.6﹪.L片段的氨基酸比较分析表明,L片段与HTN型间的同源性为97.5~98.0﹪,而与SEO型的同源性为85.3~85.5﹪.与PUU、SN和AND等其它型汉坦病毒的同源性仅为68.6~69.6﹪.结果表明84Fli株属于HTN型,并与分离自国内的HTN型病毒高度同源.
汉坦病毒 84FLi株 L片段 序列测定 系统发生树 基因分析
李新红 杨为松 白雪帆 黄长形 李光玉 杭长寿 马本江
第四军医大学唐都医院全军感染病中心(西安) 中国预防医学科学院病毒学研究所(北京)
国内会议
中华医学会第五届国际热带病暨第三次全国热带病与寄生虫学学术会议
杭州
中文
93-98
2002-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）