西瓜食酸菌调控因子CueR的生物信息学分析

摘要：

　　[目的]通过生物信息学手段对西瓜食酸菌及其它菌中的CueR 蛋白进行类比分析,为进一步验证西瓜食酸菌CueR 蛋白在铜稳态机制中的功能提供参考。[方法]以已经鉴定的大肠杆菌等4 个模式细菌中的CueR 为参照,对西瓜食酸菌与大肠杆菌、铜绿假单胞菌的、沙门氏菌的、霍乱弧菌的CueR 蛋白进行一级结构、二级及三级结构等特征分析。[结果]5 种蛋白一级结构序列、二级结构百分比、三级结构等相似但并不完全相同；5 种蛋白均为亲水性的、细胞内任何位置定位的、不稳定蛋白质,且N 端均含有蛋氨酸残基；除EcCueR 为酸性蛋白外,AcCueR 等其它蛋白均为碱性蛋白；5 种蛋白均属于HTH—MerR-SF 超家族,三级结构主要由α-螺旋和无规则线圈构成；AcCueR 可以与西瓜食酸菌中CopA 产生互作,且在copA 基因上游存在一个copA 启动子序列。[结论]推测AcCueR 蛋白与已鉴定的大肠杆菌等菌中的CueR 具有相似的结构与功能。

关键词： 西瓜食酸菌 铜稳态 CueR蛋白 生物信息学 类比分析

作者: 颉兵兵 刘君 优丽图孜·乃比

作者单位: 新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052 新疆农业大学林学与园艺学院,乌鲁木齐,830052

会议类型: 国内会议

会议名称: 新疆动物学会、新疆微生物学会2019年会

会议地点: 乌鲁木齐

会议语种:中文

页码: 56-63

在线出版日期: 2019-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）