circFOXP4通过结合miR-24-3p的功能预测分析
本研究基于竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)假说,旨在研究环状RNA(cicular RNA,circRNA)circFOXP4 的潜在功能并对其进行探讨分析。根据circFOXP4 序列信息预测结合的miRNA,并利用targetScan 和miRDB 预测miRNA 的靶基因,利用文献追踪法筛选出候选miRNA——miR-24-3p,对miR-24-3p 靶基因进行进行GO 和KEGG 功能富集分析,以预测circFOXP4 可能的作用机制。结果 表明,circFOXP4 可以结合14 个miRNA,在序列各段均有结合位点；miR-24-3p 通过两种预测方法共预测到304 个靶基因,两种软件中相同的基因有32 个,其中基因PRKCH、MXI1 均有实验证明是miR-24-3p 靶基因；功能富集分析结果显示circFOXP4 通过miR-24-3p 介导的靶基因在信号传导、激酶活性、核苷结合、MAPK 级联反应等条目中显著富集,在MAPK 信号通路、TGF-beta、FOXO等通路中富集,其中KIF3B、MAPK1 基因在多个条目或通路中均有富集。结果 提示circFOXP4 可能通过结合miR-24-3p,降低其发生,促进卵泡颗粒细胞的增殖。
环状RNA circFOP4 miR-24-3p 竞争性内源RNA
沈曼曼 曲亮 马猛 窦套存 王星果 郭军 王克华
江苏省家禽科学研究所,扬州,225216;扬州大学,扬州,225009 江苏省家禽科学研究所,扬州,225216
国内会议
江苏扬州
中文
290-298
2019-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）