猪非典型瘟病毒GX01-2018株全基因组分子特征分析
猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子.为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,命名为GX01-2018株.结果,GX01-2018株基因组全长11 565 bp,包括一个编码3 635个氨基酸的阅读框(ORF).同源性分析显示,GX01-2018株与国内代表毒株广西GX-CH 2016株、江西JX-JM01-2018A01株、广东China/GD-SD/2016、广东GD株核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为 98.2％和99.1％、92.9％和96.8％、83.4％和91.9％、90.8％和95.3％；GX01-2018株与国外代表毒株美国000515株、德国Bavaria S5/9株、奥地利AUT-2016 C株、荷兰NL1株核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为87.8％和94.2％、90.7％和95.7％、90.5％和95.5％、90.7％和95.7％.上述国内外代表毒株间Npro、Erns、E2基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为79.1％～97.2％和 82.2％～97.8％、83.0％～98.4％和 90％～99％、83.1％～96.8％和 91.1％～96.2％.基于 APPV 全基因组以及E2、Npro、Erns基因核苷酸序列绘制遗传进化树,获得相似的进化树图.来自广西的GX01-2018株与欧洲型毒株位于一个分支,而同样来自广西的GX04/2017株与美洲型毒株位于另一个分支.表明APPV流行毒株具有遗传多样性,来自同一地区的流行毒株出现较大的遗传变异.
猪非典型瘟病毒 基因组序列 遗传变异 遗传多样性 分子特征
尹彦文 施开创 孙文超 莫胜兰 陆文俊 屈素洁
广西动物疫病预防控制中心,南宁 530001 温州大学病毒学研究所,温州 325035
国内会议
南宁
中文
193-204
2019-03-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）