10株广西猪圆环病毒3型(PCV3)全基因组序列的遗传变异分析
为了解广西猪群猪圆环病毒3型(PCV3)的遗传变异情况,以PCV3阳性DNA为模板,利用PCR的方法分两段扩增PCV3并进行拼接,获得10株PCV3全基因组序列.10株广西PCV3全基因组序列之间的核苷酸同源性为98.6％-99.8％.与国内其他毒株的同源性为97.9％-99.8％；与国外其他毒株的同源性为98.8-99.7％.10株广西PCV3 Cap基因的大小均为645 bp,编码214aa.Cap基因序列比对分析结果显示,10株广西PCV3 Cap基因之间的核苷酸序列同源性在97.5％-99.8％之间,编码的氨基酸序列同源性为96.7％-100％；10株广西PCV3Cap基因与国内参考株的核苷酸(氨基酸)序列同源性在97.2％-99.7％(96.7％-100％)之间；与国外参考株的核苷酸(氨基酸)序列同源性在97.8％-99.7％(97.2％-100％)之间.PCV3 Cap基因比较保守,10株广西PCV3 Cap基因与参考株相比,仅存在散在的突变位点.采用MEGA6.06软件分别对PCV3全基因和Cap基因序列编码的214个氨基酸序列与其他参考株构建系统进化树,两者结果基本相同,结果均显示10株广西PCV3处于3a和3b两个亚群.本研究表明广西地区猪群中流行的PCV3至少存在2个亚群,不同亚群PCV3毒株的致病性差异还有待进一步的研究.
广西 PCV3 全基因 遗传变异
卢冰霞 刘磊 周英宁 何颖 秦毅斌 段群棚 李斌 陈忠伟 梁家幸 苏乾莲 闭炳芬 蒋冬福 卢敬专 杨思仪 赵武
广西兽医研究所/广西畜禽疫苗新技术重点实验室,南宁 530001
国内会议
南宁
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228-235
2019-03-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）