基于转录组分析红苞凤梨ROS清除系统
金边红苞凤梨通过组织培养分离得到的全绿苗和全白苗是分析植物过氧化物胁迫机制的理想材料。本研究以3个生长发育阶段的全绿苗和全白苗为材料,采用IlluminaHiSeq高通量测序,分析ROS清除系统相关基因的表达模式,找出红苞凤梨白化突变叶片生长发育过程中清除ROS的关键基因。结果表明：①在全绿苗生长发育过程中,差异表达基因共47个,其中ROS清除酶基因有28个,抗氧化再生酶基因4个,ROS清除蛋白基因15个；②在全白苗生长发育过程中,差异表达基因共74个,其中ROS清除酶基因有49个,抗氧化再生酶基因8个,ROS清除蛋白基因17个；③在不同发育阶段全绿、全白苗分别对比中,有7个GPX和POD编码基因、1个TRX编码基因在未展叶期的全白苗中上调表达；有2个GPX和POD编码基因在具4～5片叶期的全白苗中上调表达；有7个SOD、GPX、PrxR、POD编码基因、2个DHAR和G6PD编码基因在具9～12片叶期的全白苗中上调表达。根据基因的表达模式分析,PrxR、DHAR和TRX可能是全绿苗叶片生长发育过程中清除ROS的关键基因；而SOD、POD可能是全白苗叶片生长发育过程中清除ROS的关键基因。该研究丰富了红苞凤梨转录组数据信息,揭示了红苞凤梨全绿苗和全白苗ROS清除系统的分子差异。
红苞凤梨 ROS 转录组 全白苗 全绿苗
毛美琴 余三淼 胡豪 刘加文 薛彦斌 青杰超 林钰珂 马均
四川农业大学风景园林学院,成都611130
国内会议
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495-503
2019-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）