基于多种生物信息学数据分析SERPINE1在头颈鳞癌中的表达意义及候选药物的初步研究
目的：通过生物信息学方法探讨纤溶酶原激活物抑制剂(SERPINE1)在头颈鳞癌组织中的表达及临床意义.方法：利用 Oncomine 数据库荟萃分析SERPINE1 mRNA 在HNSC 组织和正常组织中的表达差异,HPA 数据库分析SERPINE1 的免疫组化差异；GEPIA 与GRNdb 平台分析并验证该基因与HNSC患者生存的关系；UALCAN 进行SERPINE1 与HNSC 临床特征；利用Linckedomics 获取与SERPINE1 相关的差异表达基因,并进行生物过程(BP)及KEGG、Wiki 通路富集分析；CancerSEA 用于进一步分析SERPINE1 在单细胞数据集中与不同肿瘤(包括HNSC)的功能状态之间的相关性；最后,通过(connectivity map)Cmap 识别该基因的候选药物.结果：SERPINE1 mRNA 在头颈鳞癌组织中呈现高表达,其高表达与不良的总生存预后相关.免疫组化显示SERPINE1 在HNSC 组织中高表达.SERPINE1 表达与组织学分级相关,与TP53突变、HPV 感染阳性负相关；相关差异表达基因主要参与多种黏附、连接等生物学过程及通路；在单细胞水平上,与转移、缺氧、血管生成、EMT(上皮间质转化)等正相关,与细胞周期、DNA 损伤与DNA 修复负相关,其中与转移关系最为密切；最后对差异基因通过Cmap 分析,得到评分接近1的候选化合物.讨论：基于以上分析,SERPINE1 基因作为HNSC 的致癌基因,可能以黏附、连接与迁移等生物学过程介导癌症通路促进肿瘤的转移与进展,有望成为晚期头颈鳞癌潜在的治疗靶点,profenamine(丙胺)、thapsigargin(毒胡萝卜素)、imipramine(丙咪嗪)为最具潜力的治疗药物靶标,但仍需经过更进一步的实验进行验证.
SERPINE1基因 头颈鳞癌 Oncomine数据库 TCGA数据库 数据挖掘
李丽玲 万宇翔 张巧丽 江虹霖 鲍钰东 连岩岩 张春光 黄金昶
北京中医药大学第三附属医院,北京,100029 北京中医药大学第三附属医院,北京,100029;北京中医药大学针灸肿瘤研究所,北京,100029
国内会议
北京
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68-81
2021-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）