南瓜遗传图谱构建及果实黄酮QTL定位
南瓜属于葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbita)一年生草本植物,在我国栽培利用的栽培种主要有中国南瓜(C.moschata D.)、印度南瓜(C.maxima L.)和美洲南瓜(C.pepo L.).南瓜具有丰富的多样性,富含多种功能成分,南瓜花中黄酮含量较高,目前推广的南瓜品种均为二倍体,品种多但同类型间差异少,利用中国南瓜中皮色、果形及黄酮含量性状互补的2 份亲本材料构建6 世代群体、构建了基于F2 代分离群体分子遗传图谱,并对南瓜果实长棒形(longstick,ls)、全黄性状(yellowfull,yf)进行连锁定位,对黄酮含量(flavonoids,fl)进行QTL 定位.主要结论如下：1、对中国南瓜具有性状互补的2 个亲本构建的6 世代群体进行了分析,果实全黄性状的分离比与期望值(1∶2∶1)差异显著(x2=8.22 P＜0.01),为偏向父本型偏分离的隐性性状,暂命名为yf 基因；果实长棒形性状分离比符合1∶2∶1 孟德尔遗传规律(x2=3.92 差异不显著),长棒形果实相对短棒形果实为单基因控制的隐性性状,暂命名为ls 基因.2、对经过筛选后93 个具有多态性的分子标记F2 代群体分离数据用Mapmaker 3.0 软件分析并构建遗传连锁图,图谱包含87 个分子标记、2 个形态标记、18 个连锁群,覆盖基因组1038.9cM,平均遗传距离为11.67cM,最长连锁群LGp11 遗传距离为125.6cM(9 个分子标记),最短的连锁群LGp18 遗传距离为0.5cM(2 个分子标记).yf 基因被定位到连锁群LGp2末端,与分子标记rs10‐13 和rs10‐15 较近,遗传距离分别为9.9cM 和10.4cM.ls 基因被定位到LGp7 连锁群上,与分子标记e2m2 连锁遗传距离3.7cM,与另一侧分子标记Sm87 遗传距离27.9cM.3、在遗传图谱上的89 个标记中,发生偏分离标记占24.72％,其中SRAP 标记1 个、RSAP标记9 个、SSR 分子标记11 个、yf 基因为偏父型偏分离.偏分离标记在连锁图上的热点区域分布主要分布在LGp2、LGp6、LGp10 连锁群上,且具有成簇分布的特征,其中66.7％的标记偏向父本,14.3％的标记偏向双亲、19.0％的标记偏向杂合体.4、南瓜果实黄酮含量在亲本及F2 群体中差异显著,F2 代果实黄酮含量在1.35～38.64mg.g‐1 之间,为一个连续变化的数量性状.设置阈值3.0LOD(约13.82 LR),用WinQTLCart 2.5全基因组扫描,在LGp13 连锁群上共检测到3 个与南瓜黄酮相关的QTL,分别命名为flQ1、flQ2 和flQ3.flQ1 的遗传距离为6.21cM,位于Sp8_12～Sp_129 区段之间,距离分子标记Sp1290.5cM,置信变化区间3.2～6.6cM,QTL 贡献率为46.32％.flQ2 的遗传距离为13.91cM,位于Rs_4‐12～rs1_10(rs3_10)之间,距离分子标记rs1_10(rs3_10)0.5cM,置信区间10.9～14.9cM,QTL 贡献率为39.75％.flQ3 的遗传距离为39.11cM,位于Sm130～rs5_12 之间,距离Sm13014.2cM,置信区间为32.7～52.7cM,QTL 贡献率为17.2％.
中国南瓜 黄酮 遗传连锁图
刘泽发 孙小武
湖南农业大学园艺园林学院;湖南人文科技学院 湖南农业大学园艺园林学院
国内会议
中国园艺学会南瓜研究分会2018年学术年会暨南瓜新品种展示会
苏州
中文
49-62
2018-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）