甘蔗ScPCaP1基因cDNA的克隆及RNAi载体的构建
拟南芥AtPCaP1(protein bind calcium ions attaches to the plasma membrane,PCaP1)基因编码一个定位于细胞质膜上能结合钙离子且具有亲水性的跨膜蛋白,其参与协助了病毒粒子在植物胞间连丝中的运动,缺失该基因可导致芜菁花叶病毒在拟南芥中的累积量下降.本研究在甘蔗转录组数据库中搜索到与AtPCaP1 具有一定同源性的部分序列,并利用RACE(Rapid amplication of cDNA ends,RACE)技术从甘蔗品种台糖22的总RNA 中克隆出完整的cDNA,命名为ScPCaP1,GenBank 收录号为KT891986.ScPCaP1基因的cDNA全长为1 159 nt,5'端非编码区和3'端非编码区分别含有145 nt和312 nt,编码区包含一个702 nt的开放阅读框(open reading frame,ORF),预测编码一个234个氨基酸的蛋白质,其分子量约为24.7 kD.同源性分析表明ScPCaP1 与拟南芥AtPCaP1 编码的蛋白的一致性为53.6％,与玉米和高粱的PCaP1 蛋白一致性较高,分别是80.8％和85.2％.本研究进一步构建ScPCaP1 基因的RNAi(RNA interference)载体,用于后续研究ScPCaP1 在甘蔗抗病毒育种方面的作用及其他功能.
甘蔗 RACE ScPCaP1 病毒运动 RNAi
袁军涛 桂超亚 白如梦 温荣辉
广西大学生命科学与技术学院,广西大学,南宁,530005 广西大学生命科学与技术学院,广西大学,南宁,530005;亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西大学,南宁,530005
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3073-3078
2017-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）