基于CGE技术的甘蔗SSR-PCR反应体系优化
[目的]优化基于毛细管凝胶电泳(CGE)技术的甘蔗SSR-PCR反应体系,为甘蔗遗传多样性和亲缘关系研究、分子辅助育种及遗传图谱构建提供技术支持.[方法]基于CGE技术,采用正交试验设计,选择dNTPs浓度、DNA聚合酶量、引物浓度和DNA模板量为考察因素进行优化,确定最佳SSR-PCR反应体系,并用于8个甘蔗种质资源材料的遗传多祥性分析.[结果]最佳SSR-PCR反应体系(20 μL)：dNTRs浓度0.15 mol/L.DNA聚合酶1.5 U,引物浓度0.50 μmol/L,DNA模板量25 ng.利用该体系对8份来自不同国家地域的甘蔗种质材料进行遗传多样性分析,发现8对SSR引物共扩增出101个片段,其中多态性片段为93个,多态性比率为92.1％.聚类分析结果表明,参试材料间的遗传相似性系数为0.521～0.871,在相似性系数为0.614处,所有参试材料可分为两大类,3份国外种质材料PINDAR、CP72-1210、CP84-1198与ROC20、GT69-156聚为一类；而ROC26、GT02-237和GT97-69聚为另一类.[结论]基于CGE技术的SSR-PCR反应体系检测结果稳定,重复性好,适用于甘蔗的遗传分析及遗传作图.
甘蔗 SSR分子标记 毛细管凝胶电泳(CGE) 反应体系 遗传分析
桂意云 陈忠良 秦翠鲜 汪淼 刘丽敏 李杨瑞 黄东亮
广西农业科学院 甘蔗研究所/中国农业科学院 甘蔗研究中心/广西甘蔗遗传改良重点实验室/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室,南宁530007
国内会议
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1463-1469
2017-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）