中国161个青花菜代表品种SNP指纹图谱构建与遗传进化分析
为了对国内青花菜品种更准确、快速的鉴定和识别,本研究采用SNP分子标记来构建青花菜品种DNA指纹图谱,并揭示这些品种的遗传多样性和遗传背景.收集国内近20年青花菜品种161份,基于甘蓝基因组设计315对高质量的SNP标记,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳技术构建这些品种的指纹图谱,并采用NTSYS pc version 2.10软件,对这些品种进行遗传多样性和遗传进化分析.结果表明,利用性状差异性较大的3份青花菜材料,从315对SNP引物中筛选出10对多态性好、分辨率高的引物.10对SNP引物共扩增出78个变异位点,每对引物检测到4～14条多态性条带,平均每对引物扩增8条,多态性指数(PIC)为0.10～0.99.161份品种遗传相似系数变化范围是0.51～0.95,在相似系数0.61处可将161份青花菜品种分为四大类(A、B、C和D亚群).A亚群包含72个品种,CMS×S类型有19个,SxS类型有53个,国外品种有8个,国内品种有64个；B亚群含70个品种,类型分别为CMS×S类型有44个,MS×S类型有22个,S×S类型有4个,是70个国内品种；C亚群只包含一个品种B3697,为CMS×S类型,这是国内特有的青花菜F1品种；D亚群包含18个品种,都为CMS×S类型,它们是国内品种.从聚类分析可以看出,国外品种分布在A亚群,国内品种分布在B、C、D亚群,A亚群中有8个国外品种,有64个国内品种,这暗示了国内育种的部分品种与国外品种在遗传背景上多数相似,但国内多数品种与主流品种仍有差距.同时,该研究构建了 161份青花菜品种的DNA指纹图谱,可用于对品种鉴定和种质分析.本研究在国内外首次采用较多的青花菜品种对国内青花菜进行指纹图谱构建和遗传进化分析,为分子育种和应用基础研究奠定了基础.
青花菜 SNP 指纹图谱 多样性 遗传进化分析
黄静静 李占省 刘玉梅 方智远 杨丽梅 庄木 张扬勇 吕红豪
中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100081
国内会议
武汉
中文
55-75
2018-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）