2017年上海市金山区柯萨奇病毒A组6型VP1基因系统发育分析
目的 分析金山区2017年三起手足口病聚集性疫情中分离到的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)VP1基因特征.方法 对金山区2017年采集到引起手足口病聚集性疫情的4株CV-A6毒株进行VP1全长基因扩增和序列测定,进而应用Muscle、MEGA和DNAstar进行序列比对、构建系统发生树和分析核苷酸同源性.结果 4株CV-A6分离株均属于E2亚型,其VP1基因同源性为99.7％～100％；与A亚型代表株AY421764(Gdula/2004)和B亚型代表株JQ364886(SD/CHN/1992)核苷酸同源性均较低,分别为82.6％～82.8％和83.5％～83.7％；与C亚型代表株同源性为84.2％～85.2％；与D亚型代表株同源性为88.4％～91％；与E1和E2亚型代表株同源性分别为91.1％～92.8％和94.4％～99.5％.结论 金山区2017年手足口病聚集性疫情CV-A6分离株均属于E2亚型,E2亚型CV-A6为当前引起金山区手足口病聚集性疫情的绝对优势流行株.
柯萨奇病毒A组6型(CV-A6) 系统发育分析 同源性分析
董兆鹏 孙箐爽 臧浩 王唐 蔡光 李淑华 宋灿磊
201500 上海市金山区疾病预防控制中心
国内会议
内蒙古海拉尔
中文
55-61
2018-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）