低致病性新城疫病毒在华中地区的分子进化研究
目的 了解华中地区新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的流行及起源,揭示其分子进化与传播模式.方法 采用HA试验、RT-PCR检测野生鸟类与家禽的新城疫病毒感染情况,二代测序得到基因组序列,与GenBank中所有可获得全长(1662nt)的F基因进行遗传进化分析.结果 115株家禽源NDV、2株野鸟源NDV被鉴定为Class Ⅰ-1b基因型,4株家禽源NDV、12株野鸟源NDV为Class Ⅱ-Ⅰ基因型,7株家禽源NDV为Class Ⅱ-Ⅱ基因型,所分离毒株F蛋白裂解位序列为112E/G-K/R-Q-E/G-R-L117,均符合弱毒株特征.Class Ⅰ分子进化速率为3.958E-3,Class Ⅱ为7.377E-4.结论 华中地区至少有三种基因型的低致病性新城疫病毒参与流行循环,候鸟不同迁徙路线交汇以及野鸟与家禽间的互相传播可能导致变异或新基因型的出现,对家禽造成了潜在威胁,持续监测野鸟及活禽市场感染情况对防控新城疫爆发具有重要意义.
新城疫病毒 弱毒株 分子进化
贾李佳 刘海舟 王润琨 陈全姣 刘翟
430071 中国科学院武汉病毒研究所
国内会议
内蒙古海拉尔
中文
115-122
2018-06-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)