农村寄宿制学校宋内氏志贺菌菌痢暴发调查及全基因组溯源分析
目的 对陕西省3起寄宿制学校感染性腹泻暴发事件进行流行病学调查,病原分离鉴定及分子溯源分析.方法 开展现场暴发调查,描述疫情三间分布,分析流行特征.采集病例肛拭子标本、剩余食物、环境及水源标本,进行病原分离鉴定.选择代表菌株进行PFGE分子分型,全基因组MLST、SNP分析,预测毒力基因谱及耐药基因谱.结果 2017年8月-9月报告的3起疫情共发病282例,以发热、腹泻为主,里急后重及粘液脓血便症状不明显,均为学生群体,无性别差异.病例肛拭宋内志贺菌检出率为62.22％(56/90),肛拭ipaH基因检测阳性率为69.70％(46/66),环境样本阳性率为12.31％(8/65)；PFGE、全基因组MLST、SNP分析表明,3起疫情代表菌株不同源.毒力基因预测共有12种毒力基因.耐药基因预测有氨基糖苷类、甲氧苄啶类、磺胺类、β-内酰胺类、四环素类、大环内酯类的耐药基因.结论 陕西省3起寄宿制学校宋内氏志贺菌引起的细菌性痢疾暴发之间无直接关联,病原菌毒力基因谱与国内常见宋内志贺菌特征一致,存在多重耐药基因.
宋内氏志贺菌 寄宿制学校 PFGE wgMLST wgSNP
刘东立 张义 马国柱 曹磊 石一 李文涓 刘长宏 史伟 王舒 张铮 宁少奇 孙亮 关蓉晖 张同军 刘峰
710054西安,陕西省疾病预防控制中心
国内会议
内蒙古海拉尔
中文
222-233
2018-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）