苦玄参转录组EST-SSR引物开发及群体遗传多样性分析
目的：探索18个苦玄参种群的遗传多样性及亲缘关系,为苦玄参的资源评价及开发利用提供依据.方法：采用EST-SSR引物开发技术,利用SSR分子标记,分析18个种群的基因多样性指数(Nei)、Shannon多态信息指数(I)、多态百分率(P)、多态信息含量(PIC)、杂合性(Het)、基因流(Nm),并计算各种群间的遗传距离,基于遗传距离对其进行聚类分析,明确各群体间遗传多样性及亲缘关系.结果：从100对EST-SSR标记中,筛选出具有多态性的标记48对,基于18个种群,随机抽取用于试验的20对引物共扩增出71个等位基因,平均每对引物3.55个.各引物间P变化范围为0～40.7％,平均19.9％；PIC变化范围为0～0.7941,平均0.3977；I变化范围0～1.8143,平均0.8084.Obs Het变化范围0～0.4423,平均值0.2127；Exp_Het变化范围0～0.8269,平均值0.4558.18个种群近交系数Fis值在-0.0953～0.6639之间,平均0.1592；总群体内亚群间的近交系数Fit值在0.0626～0.8587之间,平均0.5372；遗传分化系数Fst在0～0.686之间,平均0.4496.基因流(Nm)在0.1144～0.7594之间,平均值为0.3061.各种群Nei变化范围0～0.4016、I变化范围0～0.6209,最高的为广西梧州,其次为龙州,云南普洱龙潭乡为单态.云南景洪勐龙镇和云南景洪景哈乡遗传距离最近,仅0.0319；广西龙州和云南勐海县打洛镇遗传距离最大,为0.9638,亲缘关系最远.在遗传距离0.3213处,可将18个种群分成3个群体,其中广西三个种群归入同一群体,云南勐满镇、勐伦镇及勐遮镇归为同一个群体,其余种群归为第三个群体.结论：供试18个种群遗传分化水平不一致,各种群杂合度差异较大.种群间基因流较小,群体基因交换不大；群体内存在一定的近交率.群体亲缘关系受地理隔离及环境因素各方面的影响.
苦玄参 SSR 遗传多样性
谢阳姣 杨帆 李耀燕 闫国跃 白燕远
广西中医药大学,南宁530001
国内会议
南宁
中文
304-318
2018-05-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）