MiR-497-195基因簇在宫颈癌组织中的表达及预测靶基因的生物信息学分析
目的:探讨miR-497-195基因簇在宫颈癌组织中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析,为miRNA-497-195基因簇在宫颈癌发生中的作用机制研究提供理论基础. 方法:用real-time RT-PCR对miR-497和miR-195在宫颈癌组织中的表达进行相关性分析.利用miRNA芯片技术检测宫颈癌组织中miRNA表达谱,用real-time RT-PCR进行验证;通过生物信息学预测miR-497和miR-195的靶基因,并对其靶基因进行GO(gene ontology)功能富集分析及信号转导通路富集分析. 结果:miR-497和miR-195在宫颈癌组织中的表达呈明显的相关性.芯片结果显示宫颈癌组织中有15个miRNAs表达为上调(>2倍),10个miRNAs表达为下调(<0.5倍),其中miR-195和miR-497显示为下调.miR-497和miR-195预测靶基因大量重合,且集合功能也大量重合,并富集于细胞周期调控、生物学过程调控、转录调控、基因表达、及核苷酸代谢过程等生物学过程,以及蛋白结合、核酸结合、蛋白激酶活性、连接酶活性等分子功能(p<0.01);KEGG通路分析涉及癌症通路、p53信号通路、GnRll信号通路、细胞外因子信号通路等信号传导通路及直肠癌、前列腺癌、甲状腺癌、黑色素瘤、慢性粒细胞性白血病、非小细胞肺癌等疾病通路(p<0.05). 结论:miR-195和miR-497在宫颈癌组织中呈现低表达,二者表达呈相关性,可以作为miR-497-195基因簇来研究其对宫颈癌的影响.miR-497和miR-195预测靶基因功能大量重合,并显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中.
宫颈癌 病理机制 微小RNA-497-195基因簇 基因表达 靶基因 生物信息学
刘珍 胡晓霞
广西壮族自治区人民医院妇科
国内会议
南宁
中文
119-130
2015-05-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)