产电微生物中的G-四联体及基因的调控作用
富含鸟嘌呤G的重复核酸序列可以形成G-四联体.研究发现,G-四联体结构在基因组的稳定性、端粒合成过程、基因转录和翻译水平的表达调控、基因重组等有着至关重要的作用.本文旨在研究地杆菌(Geobacter)中G-四联体的分布,探讨G-四联体对产电菌Geobacter sulfurreducens PCA胞外电子转移过程的影响.首先,利用QGRSMapper、ImGQfinder、quadparser2筛选地杆菌基因组中的G-四联体序列;其次,将其比对到基因上,确定G-四联体在特定基因中的位置,进而阐明不同位置上的G-四联体序列可能的基因调控作用;最后,通过基因功能富集和蛋白相互作用关系分析G.sulfurreducens PCA中的G-四联体基因,得到胞外电子转移直接相关的G-四联体基因,有助于进一步通过实验发现影响微生物的胞外电子转移并受G-四联体调控的关键基因.
产电微生物 胞外电子转移 G-四联体 基因调控
谷宝华 丁德武 束传军 孙啸
东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室,江苏 南京 210096
国内会议
南京
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2015-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）