东方拟无枝酸菌 HCCB10007 全基因组测序
东方拟无枝酸菌属于稀有放线菌,其产生的万古霉素是抗MRSA感染的一线药物。研究发现东方拟无枝酸菌 HCCB10007 基因组由8,948,591个碱基组成,为环形染色体,预测到共8168个编码蛋白。生物信息分析表明,其与地中海拟无枝酸菌U32有较多的直系同源基因,间接证明了两者相近的亲缘关系。分析东方拟无枝酸菌HCCB10007基因组结构发现,与地中海拟无枝酸菌U32一样,具有核心区和非核心区,以及“类核心区”嵌合在非核心区中,这个“类核心区”具有与核心区相似的基因结构特征。同时,我们还在基因组中发现至少26个与次生代谢产物合成相关的基因簇,其中有19个分布在非核心区,但万古霉素合成基因簇位于核心区中,暗示了万古霉素对于该菌株的重要性。
东方拟无枝酸菌 基因组结构 万古霉素
徐莉 赵维 朱丽 赵国屏 陈代杰 戈梅
南京农业大学 上海来益生物药物研究开发中心
国内会议
南宁
中文
96-100
2011-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）