昆明盐矿古老岩盐沉积中的原核生物多样性
本文应用DGGE和rRNA分析法研究了昆明盐矿古老岩盐沉积中的原核生物多样性.提取的样品总DNA可以直接用于PCR扩增.DGGE分析中细菌得到27条带,古菌得到18条带.样品的DGGE图谱与通过纯培养得到的20个属菌株的DGGE图谱对比分析发现,细菌19个属菌株的条带,只有1个属菌株与环境样品中的1条带迁移位置一致;古菌1个属的菌株不与环境样品中的任何条带迁移位置一致.表明纯培养菌株并非该环境中的优势类群,该环境中含有丰富多样的未培养或不可培养原核生物.同时,建立了样品的16S rDNA克隆文库,从中分别挑取了36个细菌克隆和20个古菌克隆进行ARDRA分析.从中筛选得到10个细菌OTUs,其中3个OTUs是优势类群,分别占38.9％、25.0％、16.7％,其余7个OTUs各含有1个克隆.古菌得到8个OTUs,没有明显的优势类群.每个OTU的代表克隆序列分析表明,细菌主要为Pseudomonas属,古菌主要是Halorubrum,Haloterrigena和未培养古菌.克隆和DGGE分析都表明,昆明盐矿古老岩盐沉积具有较丰富的原核生物多样性,含有大量未知的、未培养或不可培养的原核生物.但在原核生物物种组成上,免培养所得结果与此前的纯培养研究所得结果存在一定差异.该研究为古老岩盐沉积中微生物资源的研究、保护、开发与利用奠定了基础.
古老岩盐沉积 克隆文库 原核生物 DGGE分析法 rRNA分析法
肖炜 彭谦 刘宏伟 文孟良 崔晓龙
云南大学云南省微生物研究所,昆明,650091
国内会议
杭州
中文
257-265
2006-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）